Majelis Perwakilan Mahasiswa Ikatan Mahasiswa Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia (MPM IM FKM UI) adalah lembaga tertinggi dalam IM FKM UI yang memegang kekuasaan legislatif dan yudikatif
Badan Eksekutif Mahasiswa Ikatan Mahasiswa Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia (BEM IM FKM UI) adalah pimpinan tertinggi lembaga eksekutif dalam IM FKM UI
AKG FKM UI adalah himpunan mahasiswa gizi yang menaungi pengurus (fungsionaris AKG FKM UI) dan anggota (seluruh mahasiswa gizi aktif) sebagai wadah aspirasi, apresiasi, dan pengembangan diri mahasiswa gizi FKM UI
Analitico FKM UI adalah Himpunan Mahasiswa Departemen Biostatistika dan Ilmu Kependudukan menaungi peminatan Biostatistika serta Manajemen Informasi Kesehatan.
Episentrum FKM UI adalah Lembaga Kemahasiswaan yang bergerak di bidang peningkatan dan pengembangan kompetensi keilmuan mahasiswa Departemen Epidemiologi Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia
HAPSA FKM UI merupakan lembaga kemahasiswaan yang berfokus pada pengembangan potensi keilmuan, keterampilan, dan kepekaan mahasiswa Departemen Administrasi Kebijakan Kesehatan Fakultas Kesehatan Masyarakat
OHSC FKM UI adalah Himpunan Mahasiswa Departemen Keselamatan dan Kesehatan Kerja (K3) yang hadir sebagai media atau tempat untuk pengembangan dan pengimplementasian keilmuan K3 di lingkup K3 FKM UI, FKM UI, UI, dan masyarakat umum.
PIK-R Rumpan FKM UI merupakan sebuah lembaga pusat informasi dan konseling dengan melakukan edukasi dan advokasi terkait isu-isu kesehatan reproduksi kepada civitas akademika FKM UI, civitas akademika UI, dan masyarakat secara umum.
Envihsa FKM UI merupakan Himpunan Mahasiswa Departemen Kesehatan Lingkungan yang hadir sebagai tempat bagi mahasiswa Kesehatan Lingkungan untuk mengembangkan diri, berkolaborasi, dan memberikan kontribusi kepada sesama mahasiswa, masyarakat, dan lingkungan dalam menghadapi perkembangan isu berdasarkan ilmu kesehatan lingkungan.
Tatranesa FKM UI merupakan sebuah komunitas tari tradisional bagi mahasiswa FKM UI. Tatranesa berpartisipasi dalam misi pelestarian budaya tarian tradisional melalui pelatihan tari, penyebaran informasi seputar tarian tradisional di seluruh wilayah Indonesia, hingga misi budaya lintas negara.
Nuansa Persaudaraan Islami Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Indonesia (Nurani FKM UI) merupakan Lembaga Dakwah Fakultas (LDF) sekaligus Unit Kegiatan Mahasiswa Kerohanian (UKMK) yang berada di FKM UI dengan visi menanamkan nilai-nilai islam yang dekat, berdampak, dan melekat untuk mewujudkan masyarakat FKM UI yang madani.
Pasatwa FKM UI (Pecinta Alam Satya Wasista) merupakan Lembaga Kemahasiswaan yang mewadahi mahasiswa FKM UI yang memiliki minat dan kecintaan lebih terhadap alam.
KPK Sehat merupakan himpunan mahasiswa promosi kesehatan FKM UI yang berfungsi sebagai wadah bagi mahasiswa promosi kesehatan untuk meningkatkan core competencies. Himpunan ini menjunjung tinggi nilai-nilai kolaboratif, profesional, dan progresif, dengan tujuan menyebarkan kebermanfaatan. Sejalan dengan tagline “Act to Impact,” KPK Sehat berkomitmen untuk melakukan tindakan nyata yang berdampak positif bagi kesehatan masyarakat.
HME FKM UI adalah himpunan mahasiswa ekstensi sebagai salah satu lembaga eksekutif Himpunan Program Mahasiswa Program Kekhususan (HMPK). Anggota HME merupakan mahasiswa Sarjana Kesehatan Masyarakat dari 4 peminatan yang berlaku yaitu Epidemiologi, Promosi Kesehatan, Administrasi Kebijakan Kesehatan, dan Kesehatan Reproduksi. HME hadir untuk memberikan wadah kreatif dan kegiatan interaktif bagi lingkungan civitas akademika FKM UI dan masyarakat umum.
HMP FKM UI adalah himpunan mahasiswa pascasarjana yang menaungi empat program studi jenjang magister yaitu Prodi Ilmu Kesehatan Masyarakat, Prodi Keselamatan dan Kesehatan Kerja, Prodi Kajian Administrasi Rumah Sakit, Prodi Epidemiologi dan dua program studi jenjang doktoral yaitu Prodi Ilmu Kesehatan Masyarakat dan Prodi Epidemiologi. HMP berperan sebagai wadah bagi mahasiswa Pascasarjana FKM UI untuk mengembangkan kemampuan akademik dan non-akademik dengan mengadakan berbagai kegiatan seperti seminar, pelatihan, pendampingan beasiswa, kegiatan sosial, serta program yang mendukung kesehatan masyarakat baik di dalam maupun luar kampus. HMP juga memfasilitasi aspirasi mahasiswa dan mempererat hubungan antar mahasiswa serta dengan pihak fakultas.